Se como vc desinstalou o flash não ocorreu mais os problemas...
Mas vamos pensar o seguinte:
Como o sistema se comporta quando processa algo pesado?? Já testou algum game pesado??
Vamos supor o pior caso e que o flash fez os recursos da placa serem usados e por isso travou tudo bem??
Então...
Baixe algum game pesado e jogue por um tempo, teste vídeos pesados, enfim coloque a placa para "suar". Se ela aguentar beleza, se não aí sim suspeite dela...
Com isso vc poderá ficar tranquilo quanto a problemas que ela possui ou não...
Outro detalhe:
Vc reinstalou o driver ou está com uma mistureba aí??
Mais uma coisa a se pensar...
Já teve vezes que eu fiz uma clonagem do meu sistema em pen drive e depois apaguei tudo e instalei o windows par ver a estabilidade com jogos pesados.
Baixei o Flash 9 (não sei se é o de 32 ou de 64, confesso que não olhei), segui os procedimentos que o platao indicou, mas o Firefox não reconheceu o plugin.
É só descompactar e copiar o arquivo para /usr/lib/mozilla/plugins/ e depois reiniciar o firefox.
Espero que ajude...