ahuron,
Boa noite. Pacotes com extensão ".deb" já são compilados, não há muito mistério em como instalá-los: no caso do Ubuntu, baixe o pacote, dê duplo clique e siga as intruções (mais ou menos como aqueles instaladores do Windows, em que você executa o programa e vai clicando em "Next", "Next", "Finish"...)
Cabe lembrar que pacotes ".deb" necessariamente não foram compilados para todas as versões do Ubuntu ou Debian. Exemplo: Você pode ter um mesmo pacote compilado para a versão do Ubuntu 8.04, outro para a versão 8.10, outro para a 9.04, etc... Normalmente, isso é bem documentado (e se houver alguma incompatibilidade, o próprio "instalador" do pacote lhe informará), mas não custa ressaltar que "forçar" a instalação de um pacote incompatível pode comprometer a estabilidade do sistema.
O comando "apt-get" utiliza o que a comunidade Linux convencionou chamar "repositórios". Os repositórios nada mais são do que bancos de dados específicos para a versão do seu sistema, o que quer dizer que através do apt-get é bastante improvável que a instalação de algum programa comprometa o sistema de alguma maneira.
Além do "apt-get", que é uma ferramente em modo texto, experimente a opção "Adicionar/Remover" no menu "Aplicações", ou o "Gerenciador de pacotes Synaptic" no menu "Sistema>Administração".
Um abraço!!