Mais pesado de cara? 
Acho q não, se vc tem uma máquina velha vai sentir dificuldades. mas só se a máquina for muito velha mesmo, ai nao tem jeito de aproveitar o compiz. E vale lembra q ele vem desativado por default, quem quer o ativa, quem nao pode usá-lo desinstala pra economizar espaço no hd.
Uso ubuntu com compiz ativado em duas máquinas muito distintas, um notebook dual core com placa de video geforce 7900 e um desktop single core com placa onboard da intel, e não sinto nenhuma diferença no desempenho, nenhum lag ou travadinha. Dizem, nao sei se é verdade, q o compiz pode até acelerar a máquina uma vez q passa a usar o processador de vídeo q era ocioso a maior parte do tempo abaixando assim um pouco da carga da cpu.
resumindo. é mais pesado? sim e não, pois quando se trata de interface a matemática é diferente. não existe diferença entre 10ms e 30 ou 40ms. mesmo q seja 3 ou 4 vezes mais tempo, se o resultado é mais "bonito" então vale apena. O tempo de reação humana não diferencia entre eles e o feedback dado será na ordem de 2 ou 3 segundos mil vezes maior (tempo para descobrir q abriu a janela errada e fechá-la por exemplo). muito diferente de operações sobre arquivos ou rede onde o feedback é dado por operações automáticas dentro da mesma ordem de grandeza de tempo.
