Ao instalar o Unity 2D, você terá a opção de escolher ele na tela de login do seu usuário, assim como qualquer outro desktop que você instalar (KDE, Gnome Shell, Mate, Xfce e etc). É só apertar o botão que tem um ícone do Ubuntu, do lado do nome de usuário lá na tela de Login, e escolher o Unity 2D. Se não der certo ou vc notar algo estranho nesse desktop, é só fazer logout e mudar para o Unity 3D. Entendeu a ideia? Você não vai trocar, só vai adicionar uma opção a mais de desktop no seu Ubuntu.
Só tem que ver se há o Unity 2D nos repositórios do Ubuntu ainda, dá uma olhada lá na Central de Programas.
O Ubuntu 12.04 já vem com o Unity 2D, por que vc não tenta instalar ele e ver como é que fica? Esse Ubuntu 12.10 está mais para uma versão de testes, tem muito bug e está pesado demais para muitas máquinas. E ainda por cima só tem 1 ano e meio de suporte. O 12.04 tem 5 anos de suporte!