Cara, os botões de minimizar, maximizar e fechar do lado esquerdo fazem muito mais sentido... até no windows!!! Se ficassem do lado esquerdo, seria mais fácil vc alcançar o Menu Iniciar depois de minimizar ou fechar um programa, não seria?
No Unity é a mesma coisa, a ideia é vc minimizar ou fechar um programa, e ir para o lado esquerdo, para abrir outro programa. A barra fica do lado esquerdo para poupar espaço na tela, e também pq atrapalha menos (imagina do lado direito, do mesmo lado das barras de rolagem).
Mas se não gosta do Unity de jeito nenhum, vc pode tentar o
Linux Mint. Ele vem com um desktop mais voltado para iniciantes, inclusive os botões ficam do lado direito, rsrs. Tente o
Linux Mint 13 com desktop Mate, eu estou usando e gostando. Habilite o repositório de backport.