Partição home, vai unica e exclusivamente da sua vontade ter ou não, eu tenho.
Se já tem tudo que precisa na partição de arquivo, ela não se faz necessario, a não ser que você queira guardas as configurações dos aplicativos.
Só completando, dentro da pasta home é guardado também, além das configurações de aplicativos, as configurações do seu usuário e outras coisas como:
Informações do ambiente grafico (Temas, Icones, etc...).
Histórico de comandos (/home/usuário/.bash_history).
Configurações personalizadas dos aplicativos (Mozilla, ssh, e outros programas que pode vir a instalar como player de audio, vídeo, etc...).
Configurações personalizadas do sistema (Aplicativos padrões para determinados arquivos, comportamento de janelas, etc...).
E por ai vai.
Mesmo que não venha a fazer qualquer personalização no sistema ou alteração nas configurações do seu usuário, é recomendável manter a pasta home para evitar problemas, até mesmo por que, em relação a espaço em disco ocupado pelos arquivos de configuração do usuário, chega a ser irrelevante visto que seus documentos não estarão lá.
De o comando ls -la dentro da pasta home do usuário e veja a quantidade de pastas ocultas.
Veja que, por exemplo, algumas das configurações personalizadas do gnome (ambiente gráfico) para o usuário, se encontram dentro da pasta .gconf
Entretanto, cuidado por que sua remoção pode ou não ser refeita facilmente caso exista necessidade futura.
Mesmo recriando o diretório home do usuário, você não irá recriar os subdiretórios.
Pode ser (
talvez) que tenha de reinstalar uma ou outra aplicação.