cgaviao,
Sim, é possível, a forma mais fácil é ter o /home numa partição em separado, e configurar o /etc/fstab em ambos os sistemas para utilizar esta partição.
Para alem disso ha alguns cuidados especiais.
Os ids numericos dos utilizadores tem que ser os mesmos em ambos os sistemas.
As aplicações utilizadas (firefox, etc) devem ser as mesmas versões caso contrário pode ter problemas de compatbilidade nas opções ou dados das mesmas...