Eu tenho processador de 64 bits, mas de pelo menos de uma dúzia de vezes que instalei uma distro Linux, somente uma vez, usei um SO de 64 bits. Pode instalar o de 32 ou de 64 bits que não vai ter nenhum problema quanto à compatibilidade de software. Todos os aplicativos de instalação de softwares do Ubuntu,eles reconhecem o sistema que está usando e instala o programa adequado. Quando usei o Ubuntu 10.04 de 64 bits, não instalei nada, bibliotecas, pacotes, manualmente, e quando ia instalar um programa, o terminal instalava tudo que era necessário automaticamente.