Caro amigo adilson bts
recentemente tive alguns problemas com o compiz no unitty tambem, ao aplicar alguns efeitos e configurações o compiz desarruma tudo em meu desktop, ao reiniciar ficava tudo bugado, menu lançador entre outras coisas, tive que reinstalar o ubuntu, gorto de uma interface limpa, coisa de perfeccionista kkkk, então vamos la, a unica maneira de resolver isso foi quando logo após instalar o ubuntu, a 1° coisa que fiz foi instalar o compiz e configura-lo ao meu gosto, reiniciei e ficou uma beleza, uma dica depois não mecha mais nas configurações do compiz e seja feliz com o unitty.
Atualmente uso um conjunto de programas em conjunto:
Compiz + Cairo-dock + screenlets, desktop uma beleza.
No entanto é bom aguardar algumas correções do unitty em conjunto com o compiz, no momento va usando ele como te falei, forte abraço.