Ola
Se o sistema está zerado:
1) Instale o Windows e escolha na instalação => remover a partição (tecle "C")
2) Crie uma partição com o tamanho desejado para o windows apenas ( 50 gigas está de bom tamanho, para anti virus, office e algum outro programa) calculando o que vai instalar no futuro.
3) deixe o restante em "branco"
4) reboote e verifique que o windows esteja funcionando de acordo.
5) Instale o Ubuntu e escolha " lado a lado" na hora da seleção de partições ou formate manualmente deixando 15 gigas para raiz "/" , o dobro de sua ram para /swap e o restante para /home
Considere deixar como esta seu sistema, se tem um bom processador e 2 gigas de memoria ram ou mais.
Instale o pacote virtualbox do site da Oracle, crie uma maquina virtual e instale o Windows nela.
A vantagem é rodar o Windows dentro de uma janela ou area virtual sem sair do Ubuntu.
exemplo =>
http://www.youtube.com/watch?v=xGI5lOOqMEA[]'s