é o bugado compiz, também acontece isso por aqui na minha pl. de vídeo intel
eu reinicio o X:
sudo /etc/init.d/gdm restart
mas há usuários aqui, que ñ usam o compiz por conta disso
o emerald eu, nem ativo
uma dica que pode amenizar um pouco p/ vc, instalei o fusion-icon
sudo apt-get install fusion-icon
depois ative, nele:
loose binding e o indirect rendering
p/ iniciar junto c/ o gnome:
Em aplicativos de início da sessão, adicione:
*nome: Compiz Fusion Icon
*comando: fusion-icon --no-start
*comentário: Start and manage Compiz Fusion