Acho que seu problema não é muito complicado de se resolver. Embora meus conhecimentos sejam limitados, pois ainda estou aprendendo, vou tentar ajudar.
Primeiro responda:
1. Qual é a versão do seu Ubuntu?
2. Como você instalou o driver da NVidia?
A mensagem que você recebeu pede para você rodar o comando nvida-xconfig pelo terminal como root. Você diz que não consegue mexer na configuração da NVidia. Você usou o programa NVIdia X Server Settings? Ele fica em Sistema -- > Administração --> NVidia X Server Setings. Quando ele não está instalado, executamos o comando no terminal:
sudo apt0get install nvidia-settings
Bem, o root é o superusuário do sistema. Quando você está logado como root, você pode fazer tudo com o sistema. Você tem permissões totais. Por isso, comandos executados como root devem ser feitos com muita cautela, ou você pode estragar o sistema.
Para executar um comando como root, faça o seguinte:
1. Abra um terminal.
2. Digite a palavra sudo e depois o comando que você quer. Assim, o comando que você executar terá permissão para alterar os arquivos de sistema.
sudo comando
Agora eu acho que você instalou uma versão antiga do Ubuntu, porque nas versões atuais, a instalação do driver da nvidia é praticamente automática. Essa mensagem aparecia quando precisávamos fazer a instalação no braço. Atualmente, instalamos o driver através de uma notificação que aparece no canto da tela, indicando que há drivers proprietários, ou indo em sistema --> Administração --> Drivers proprietários. Foi assim que você instalou? Se não, recomendo que baixe uma versão atual do Ubuntu. A versão atual é o Ubuntu 10.04 (Lucid Linx).
Mas se quiser tentar, muito cuidado: se você tiver arquivos importantes é melhor fazer uma cópia de segurança, pois as vezes, ao tentar fazer a instalação manual, o arquivo de configuração do vídeo é modificado erradamente, e não conseguimos mais iniciar o modo gráfico. Então, lá vai:
Para executar o comando que você recebeu da mensagem, digite no terminal o que aparece abaixo.
sudo nvidia-xconfig
Ele executará os comandos de configuração do driver da nvidia. É tudo bem rápido. Confirme sempre que for necessário.
Quando o comando terminar, reinicie a máquina.
A propósito, o X Server (ou servidor X) é o programa responsável por controlar o vídeo, o teclado e o mouse. Em um sistema Linux, esses três itens rodam sobre o X Server. Nas versões anteriores do Linux, podiamos usar o comando Ctrl + Alt + Backspace para reiniciar o servidor X. Atualmente, a única forma que eu conheço de fazer isso é reiniciando a máquina.
Boa sorte.