Sim, é possível.
Primeiro, configure o Samba para pegar a autenticação no Active Directory:
[global]
workgroup = nome-do-dominio
security = domain
password server = ip-do-servidor-windows
domain logons = no
domain master = no
Depois, use o comando abaixo pra entrar no domíno:
net rpc join -U usuario-administrador MEMBER