Olá, existe o PSPP, mas ainda está "verde" nos testes não-paramétricos.
Quanto ao resto está muito semelhante ao funcionamento do SPSS e até dá para importar/exportar dados de um para o outro.
Mas atenção que existem dados no SPSS que não são muito fiáveis (arredondamentos de várias casas decimais), isto comparando dados das mesmas amostras em SPSS e em R (mas este tem o Rcommander - GUI, mas é predominantemente feito pela consola).