Caro amigo ctsbc, uma dica bem simples para a correta instalação do grub em seu devido HD, é que ao usar o Gparted (Instalado ou via LiveCD) é optar pelo sda (Uma vez que se trata de dois Sata). Opte sempre pelo Hd que aparecer com a letra A.
Ou ainda com o CD do SuperGrub, na opção Linux Manual, escolha onde está o Ubuntu.