Estou com o mesmo problema, estou tentando executar uma aplicação em cobol compartilhada no meu servidor windows, e o dosemu não consegue executar na pasta montada pelo mount. Uma coisa que notei foi que quando você monta a pasta, o tamanho dela fica com 0 bytes (ls -l) diferente de todas as outras pastas que ficam com 4096 bytes.
Ainda não consegui descobrir também o problema, mas acredito que seja algo como permissão, mas já dei permissão para usuário na pasta e no comando mount especifiquei o usuário.. de nada adiantou.
Uma coisa que reparei é que quando você abre a pasta através do smb:// pelo nautilus, e abre o arquivo .exe com o dosemu diretamente por lá, o programa executa sem problemas, mas se você tentar executar através da pasta montada, não funciona.
Se alguém tiver alguma idéia, por favor me ajude.
Desde já agradeço,
Edson Navarro Jr.