Não precisa se preocupar, note que o bip que vem da máquina (e não do sistema, via cxs acústicas) ao ligá-la é um recurso do POST (Power On Self Test) que é aquela tela de contagem de memória, reconhecimento de disco e drive de cd/dvd e tal. Eu acho que o "bip do Ubuntu" ao qual vc está se referindo qdo o Ubuntu entra deve ser aquele som de tambor (faz "tó-goró-godó" rapidinho) que toca na tela de login. Isso é som do sistema, não tem nada a ver com "som de bip", aliás, o Ubuntu toca dois sons na máquina, um é a do login e outro é qdo o sistema qdo está pronto pra usar, esse um pouco mais longo.