Primeiramente: Não era pra escolher a parte do "Instalá-los Lado a lado, escolhendo qual iniciar".
Se você criou uma partição para o Ubuntu, deveria Especificar, a última opção de instalação do Ubuntu.
Aí na tela que abriria você teria de escolher a partição, editá-la, colocar o "journaling" em ext3 (ou ext4 caso esteja usando Ubuntu 9.04), escolher para formatá-la e colocar o ponto de montagem como uma barra pra direita, essa daqui: /
Pronto. Instalou o Ubuntu onde você queria!