Isso também acontece (fechar o Kompozer) no Jaunty, não seria problema com o GTK ou com o próprio Gnome? No Debian Lenny, que usa Gnome 2.22.3, funciona sem problemas. Eu fiz um teste, coloquei os repositórios do Intrepid e atualizei os arquivos (mais ainda ficou como 'Heron') e ao tentar abrir o Kompozer, bum!, fecha o programa. O Gnome era o 2.24 (eu acho).