Instalei o Inkscape hoje pra brincar com ele e estou com o mesmo problema. Se maximizar a janela, ele fica "pulando" e não tem como trabalhar. Trabalhar com a janela restaurada é impraticável. Uma "solução" que descobri é usar o F11 pra deixar em tela cheia, os tutoriais que pretendo seguir, deixo em outra área de trabalho e tenho que ficar trocando de um lado pro outro.
Não é a melhor coisa a se fazer, mas pode quebrar um galho de quem ta com o mesmo problema.
Quem souber a solução, por favor avise!!