Dependendo de como esta particionado seu HD você terá trabalho para acertar o Ubuntu ao final da instalação da nova distro, pois podem alterar informações de UUID das partições, e até mesmo como são referenciadas pelo sistema (/dev/hda1, /dev/sda2, e etc).
Claro que não é um bicho de 7 cabeças e todo o processo de acerto é tranquilo, isto se realmente tiver problemas, mas o processo de instalação da nova distro passa pelo reparticionamento do seu HD, abrindo assim um espaço exclusivo para este novo sistema.
Uma saída, caso seu hardware seja muito bom é virtualizar o novo sistema, sendo que ele será acessado a partir do ubuntu, e assim você poderá usar ele sem problemas para o Ubuntu. Caso queira experimentar procure por VirtualBox, ou por VMWare aqui no fórum, pois já existem bons tópicos sobre o assunto.
[]'s
Cristiano