Para trocar os servidores dos quais você baixa programas/pacotes e atualiza seu sistema é bem simples.
- Quando você estiver com o synaptic aberto vá em:
Configurações > Repositórios > (aba) Programas do Ubuntu
Na opção "baixar" você pode escolher:
-Baixar de um servidor no Brasil
-Baixar do servidor principal
-Outro (com uma lista enorme de servidores a sua escolha)
- Depois de feito isso, clique no botão recarregar para que a nova lista de pacotes seja carregada.