Olha, não sei se estou correto, mas imagina que já baixou tudo e esta no meio da atualização de fato, dá uma hora e o PC desliga?
Dependendo do momento você pode vir a ter algum problema. Eu sei que é algo que provavelmente é muito difícil de acontecer, mas aprendi nos meus longos anos de informática o quase impossível quase sempre acontece... rs...
Porque não faz a atualização apenas e no final um shutdown -h now?
E acho ser bastante difícil que um comando aconteça antes do anterior, já que uma linha só é executada quando a anterior termina.