Amigo, use o Nautilus e não o terminal. Abra o diretório por ele e cheque para ver se o arquivo ainda existe com o mesmo nome, clique com o mouse (botão direito) nele e escolha renomear.
Para usar o terminal, prefira usar a tecla "tab" para que o "bash" complete o nome do aquivo (já há uma dica neste sentido acima), evitando, assim, erros de digitação.
É importante conhecer os comandos básicos do terminal, até porque se o X não iniciar por algum motivo, vc. pode consertar o sistema por ele. Mas, para usar o sistema e condições normais, prefira o modo gráfico.