Verifique essa msg
ALERT! /dev/mapper/ubuntu--vg--root does not exist.
Parece que sua partição root LVM não está sendo montada.
Se é uma VM pra que o uso de LVM?
Eu sugiro vc criar uma nova máquina virtual Ubuntu, instalar nela o gparted e depois adicionar o HD virtual (arquivo) dessa sua máquina a nova máquina virtual. Sua Nova VM vai ter dois HD. O que foi criado com ela e o HD problemático.
Inicie essa nova VM e use o gparted pra verificar o segundo HD.