Bom... o Lime Wire é basicamente entrar no programa e esperar que todas as barrinhas ali do canto inferior esquerdo se acendam pra uma melhor conexão. Ai só começar a buscar e baixar. Por ser um P2P, e como nosso amigo Locomotion explicou, com ele você baixa de outras pessoas, é comum que arquivos mais populares venham muito rápido (pois mais pessoas tem) e arquivos meio desconhecidos demorem uma eternidade ou até nem venham.
Já no aMule, também tem o esquema de arquivos mais ou menos populares, mas lá você tem que conectar um servidor bom também, como o Donkey Server No 1 e o Donkey Server No 2. Outra dica é configurar os dados da sua conexão direitinho nas Opções e após baixado um pedaço do arquivo que você quer, defina ele como prioridade ALTA para envio, assim você vai enviar este arquivo que você vai baixando conforme vai conseguindo. Com isso você ganha créditos justamente com quem importa (quem está baixando junto com você o mesmo arquivo e, concequentemente, te enviando as partes que ele ja baixou), passando na frente na fila de espera.