Bom, depende mais de como você vai fazer aí.
Por exemplo, se você formatar a partição do Windows (com cuidado para não confundir as partições), preferencialmente para EXT4, aquela partição ficará separada da partição do Lubuntu, mas você poderá acessá-la com um simples clique pelo gerenciador de arquivos (PCManFM), pois a partição estará disponível naquele painel lateral. De grosso modo, seria como uma unidade D: no Windows.
Agora, se você quiser integrá-la automaticamente ao sistema, se eu entendi bem o que você queria dizer com isso, pode apagar a partição do Windows. Assim, você terá um espaço não alocado no seu HD e aí poderá aumentar o tamanho da partição do Lubuntu (ou partições, se tiver mais de uma). Mas atenção: isso deve ser feito de um live DVD ou pendrive e envolve risco de perda de dados, então evite mexer nas partições do sistema e tenha backup sempre.
Claro que tem mais coisa, como editar o arqivo /etc/fstab para montar a partição automaticamente, mas aí depende do que você quer.