Já experimentou uma instalação padrão do ubuntu? Eu tenho dois PCs, um com um Phenom II x4 e uma Radeon HD 4350 e um com as configurações abaixo descritas. Ambos funcionam numa boa, rápidos e rasteiros... porém com instalação padrão. Existe uma perda de desempenho ao instalar pelo wubi (não deveria ser tão perceptível, dado o poder de seu hardware, mas... existe uma perda).