Mas vc fez a atualização normal do sistema, mantendo o 12.04 da sua assinatura, ou atualizou para o 12.10?
Será que não tem a ver com o kernel? Parece que o 12.04 atualizou o kernel oficialmente do 3.2 para o 3.5, tanto é que a mídia de atualização do 12.04 virá com o kernel do 3.5. Vc ainda tem o kernel antigo? Tem uma opção no Grub, o Previous Linux ou algo assim, inicie o Ubuntu com o kernel 3.2 e veja se continua dando o problema.