Se você tiver a intenção de usar somente o Ubuntu 10.04LTS, sem a menor possibilidade de usar outra distro ou mesmo o windows, acredito que a solução mais prática seria particionar o HD em três partições:
1) / (raiz), com 50GB, em formato EXT4;
2) Swap, com 3GB (como é um notebook, a função de hibernação acaba exigindo isso);
3) /home, em formato EXT4 com o restante.
Com isso, depois de instalado o sistema integra a raiz ao /home de forma que parece uma instalação em partição única, quando na verdade estão separadas. E, se algum dia você quiser instalar outra distro ou precisar recuperar a instalação por defeito, basta apenas ter o cuidado de, ao realizar a nova instalação, marcar a raiz para a partição de 50GB e definir a partição de 400GB como /home, que em teoria seria novamente integrada, com seus arquivos, à nova instalação.