Dizer não usem o Automatix seria praticamente como dizer não usem Ubuntu, pois o Debian tem as mesmas coisas (exceto logomarcas e wallpappers), basta instalá-las.
Só que não é esse o caso, não quero criar polêmica também, mas para um usuário é muito mais fácil, prático e funcional instalar as coisas através do automatix, lá já estão reunidos os pacotes com a maioria das necessidades de um usuário comum de desktop, é fácil e intuitivo.
Os problemas existem, certamente, eu já tive alguns, mas agora me pergunto, quantos de vocês já encontraram um bug, corrigiram e enviaram ao desenvolvedor para que ele pudesse colocar a correção na nova versão?
Criticar é fácil, então continuem criticando sem contribuir com nada ou ajudem a tornar o software melhor. Se não quer ajudar o criador do programa, faça você mesmo um software melhor e que ajude e torne as coisas mais fácil para os usuários de desktop.
O que pode ser feito para facilitar a vida dos usuários é criar meta-pacotes, o dpkg permite isso, e seria muito mais fácil ter um painel com os meta-pacotes com nomes sugestivos como audio-codecs-free/audio-codecs-non-free para instalar os codecs relativos ao som por exemplo, do que ter que instalar através da linha de comando vários pacotes com nomes complexos, separadamente.