Aplicação C# com MS Frameworks.DotNet 3.5

[Chakal.tec.info]

Boa tarde galera,
eu rodo uma aplicação em minha empresa desenvolvida em C#, utilizamos o Frameworks DotNet 3.5, estou tentando tirar os Win2k da empresa e utilizar o Ubuntu, para isso preciso fazer esta aplicação rodar. Alguem tem alguma ideia como posso fazer isto acontecer?

Desde Já Grato!