Olá, Leandro.
Você pode fazer o seguinte. Abra o nautilus e dê um "Ctrl+H". Isso fará com que você visualize as pastas e arquivos ocultos do sistema. Clique em sua home (Pasta Pessoal) e localize a pasta ".compiz" (com um ponto na frente mesmo). Apague-a com um simples delete, pra que ela vá pra lixeira. Não apague definitivamente, pois você pode querê-la de volta. Isso vai deixar o seu compiz "zerado", como se você tivesse acabado de instalar. Depois veja se fica tudo ok.
Boa sorte.