Calibre não encontra nenhum livro nem plugins

[evil_queen]

Fiz uma instalação do Ubuntu, e instalei o calibre.
Eu havia salvo a pasta "biblioteca do calibre", onde ele guarda todos os ebooks.
Normalmente eu apenas substituo a pasta na minha pasta home e o calibre automaticamente reconhece os ebooks.
Porém desta vez o calibre não reconhece nada.
Já mexi nas permissões da pasta e nada, reiniciei e nada.
Tentei instalar o programa pela central de programas, desinstalei e instalei via terminal, e o problema persiste.
Usei o comando sudo python -c "import urllib2; exec urllib2.urlopen('http://status.calibre-ebook.com/linux_installer').read(); main()"
Se eu tento adicionar os livros em adicionar ebook, ele adiciona normalmente, mas aí eu teria que adicionar e editar dados um a um novamente, o que é Muuuuito chato, visto que minha biblioteca é grande.
O calibre também não reconhece nenhum plugin. Quando clico em adicionar plugin e navego até a pasta onde eles estão (em formato zip), ele mostra a pasta vazia, ou seja, não reconhece os arquivos como plugins.
Alguém teve o mesmo problema ou sabe como resolver?
Como faço pra remover o programa sem deixar nenhum rastro no sistema (pastas, configurações, etc) e tentar reinstalar do zero?