Esses programas não são desenvolvidos "para o Ubuntu", muito menos pela Canonical, que é a fundação que mantém o Ubuntu.
Se eles não têm uma "instalação gráfica", é pq quem criou o programa quis assim, não o Ubuntu. Assim, não é aqui que vc tem que reclamar...
PS: Não é recomendado baixar programas "na net", a menos que vc saiba qual é a procedência deles. A preferência é, sempre que possível, instalar programas a partir dos repositórios do próprio Ubuntu, ou seja, pela Central de Programas. Estes programas são testados e verificados pela comunidade Ubuntu, o que minimiza o risco do programa ter códigos maliciosos, ou ainda que conflitem com outras partes do sistema.