VirtualBox (4.1.2) tem agora driver específico para 3D (testado e liberado no Ubuntu).
Instalar primeiro o Guest Additions (Adicionais para convidados) e depois esse driver pelos Drivers Adicionais.
Rodei o alfa 3 completo nele (Unity 2D, Unity 3 D e GNOME Shell).
Vídeo.
Não entendi?
Isso aí que você fala e mostra na figura já era assim em todas as outras versões do Ubuntu, ou seja, quando você instala os adicionais ele gera uns módulos que ao abrir o Drivers adicionais é mostrado isso aí.
Pelo que deu a entender do que você escreveu, é que seriam coisas distintas (adicionais para convidados e o que você vê no Drivers restritos), mas são a mesma coisa.
Veja pelo pŕoprio nome que é mostrado lá:
Virtualbox guest Additions
Ou seja, adicionais para convidados do VirtualBox.
Não creio que seja a mesma coisa.
Desde que o Gnome-shell foi incluido no repositório do Oneiric estou tentando rodar a versão alfa do Ubuntu no VirtualBox, sem sucesso.
Usei as versões 4.0.8, 4.0.10, 4.0.12, 4.1.0 e não dava, funcionava só o Unity 2 D.
Agora com essa versão 4.1.2 foi diferente : a notificação oferecia um driver adicional, coisa que se acontecia antes com as outras versões, não percebi.
O fato é : instalando só os Guest Additions no modo usual a versão alfa 3 só roda o Unity 2 D.
É preciso ir aos Drivers adicionais e instalar esse driver que está sendo oferecido.
Instalando só os adicionais para convidados o Unity 3D abre como 2 D e o gnome-shell não inicia.
Instalando o driver pelos Drivers Adicionais o Unity 3D (Ubuntu) funciona e o GNOME Shell também.
Isso se aplica tanto para placa de vídeo ATI quanto Intel (testei nas duas que tenho aqui).