Pelo que sei, não dá mesmo. Baixe o programa e descompacte em uma pasta. Daí você cria um lançador no desktop com:
/opt/geogebra/jre/bin/java -jar /opt/geogebra/geogebra.jar
bem, no meu caso, descompactei na pasta /opt/geogebra
Adapte para o seu caso.
Ah, precisa do java hein.