Comigo aconteceu algo semelhante, estava usando o Ubuntu 10.04 normalmente, só que ao invés de desligar, resolvi testar a opção "Suspender", quando liguei o pc novamente, nada aconteceu, nem mensagem de erro nem nada, esperei mais de 15 minutos e nada... ai desliguei na marra e liguei novamente, abriu o sistema na maior, mas os últimos arquivos baixados da internet (durante a ultima sessão em que pese pra Suspender) desapareceram, eles estão em uma partição NTFS (pois tenho dual boot), eles sumiram completamente, nem dando o boot pelo Windows eles aparecem...
Os arquivos desaparecidos são aparentemente todos que foram criados na sessão em que suspendi mas não consegui voltar, o que pode ter acontecido?