Consegui resolver meu problema. Depois de muito pesquisar no "oráculo", obtive informações suficientes pra fazer meu computador voltar a funcionar como antes, e consegui ativar a aceleração 3D novamente.
A primeira coisa que fiz foi analisar o Xorg.0.log que se encontra em /var/log
Encontrei as seguintes linhas de erros:
(EE) intel(0): [dri] I830CheckDRIAvailable failed: glx not loaded
(EE) Failed to initialize GLX extension (Compatible NVIDIA X driver not found)
Em algum fórum (não lembro qual) sugeriam que os pacotes Nvidia poderiam estar interferindo com o driver Intel. Não sei se isso procede, mas mandei todos os pacotes nvidea pro limbo.
Pra isso basta usar o Gereniador de Pacotes Synaptic e desinstalar tudo que for NVIDIA - ***.
Ao que parece o driver Intel usa libGL.so.1.2 (do libgl1-mesa-glx) e libglx.so (do xserver-xorg-core). O pacote xserver-xorg-video-intel também deve estar instalado:
sudo apt-get install xserver-xorg-video-intel libgl1-mesa-glx xserver-xorg-core
Outro pacote necessário é o libgl1-mesa-dri
Este eu não consegui pelo apt-get, então baixei aqui
http://packages.debian.org/source/sid/mesaDepois disto é só reiniciar e esperar que tudo dê certo. Aqui no meu notebook tudo voltou a funcionar como antes.
Espero que isto possa ajudar a quem estiver com os mesmos problemas que tive.