opa,
a minha lentidão er ana verdade o link, melhoramos o link e utilizei uma regra para limitar a banda da galera aqui, delay pool, estão todos trafegando no máximo a 50 kbps/s, e limitei as extensões padrão de download em 15 kbps/s, até que deu uma segurada boa, coloquei também cache para windows update mas na realidade não sei se está funcionando, não sei que teste fazer para testar isso...
Em relação ao samba, dei uma segurada, na verdade to pensando em usar o ruindows server para isso, aí uso o samba no linux para usar os usuários do active directory e aproveitar para o squid, será que dá certo?