bom eu iria adicionar novas categorias ao menu principal editando o .menu
$ sudo gedit /etc/xdg/menus/applications.menu
iria adicionar algo assim, que seria um submenu com a categoria definida Blender e com o nome de Projetos
<!-- Projetos-->
<Menu>
<Name>Projetos</Name>
<Directory>Projetos.directory</Directory>
<Include>
<And>
<Category>Blender</Category>
</And>
</Include>
</Menu>
e depois criar o Projetos.directory para carregar um icone personalizado, caso você queira mudar o icone destes menus é pelos arquivos deste diretorio que você o fara
$ sudo gedit /usr/share/desktop-directories/Projetos.directory
com algo assim
[Desktop Entry]
Type=Directory
Name=Projetos
Icon=aqui vai o icone
Encoding=UTF-8
e por ultimo as aplicações teriam estes dados em seus icones
$ sudo gedit /usr/share/applications/Blender.desktop
[Desktop Entry]
Name=Blender
Comment=Blender
Exec=/home/unfear/Programas/blender/blender
Icon=application-blender
Terminal=false
Type=Application
Categories=Application;Blender;
