O pessoal que usa Gentoo costuma dizer que usar tudo compilado deixa o SO mais rápido. Mas quem diz isso são os fãs do Gentoo, pois os que simplesmente o testam dizem que a diferença é tão pequena e o trabalho tão grande que não vale a pena.
Então, para que perder um tempo enorme e ter um monte de dores-de-cabeça? Instale pacotes binários (pré-compilados), de preferência pelo adicionar-remover do Ubuntu (ou pela dupla APT/Synaptic).
E se o pacote (software) que vc quer não está disponível nos repositórios do Ubuntu, um bom lugar para encontra-lo é este:
www.getdeb.netFinalmente, caso vc insista em compilar (ou realmente necessite, pois é fato que alguns softwares pouco comuns só são disponibilizados em código-fonte), recomendo a leitura deste tópico:
http://ubuntuforum-br.org/index.php/topic,24521.0.htmlAté outra vez.