Não é quando está usando bateria, é geral, mas não afeta todos os notebooks. No da minha cunhada, um Positivo, nunca teve problema, o Load_Cycle_Count dela está perto de 1000, depois de meses de uso. O meu, um ACER, em 2 semanas chegou a quase 3000. A vida útil é algo em torno de 500.000 ou 600.000, para os hds mais novos.
Execute o comando abaixo para ver como está o seu HD, supondo que seja sda:
sudo smartctl -a /dev/sda | grep Load
Load_Cycle_Count é o que você procura.
E lembre-se que isso não é um problema do Ubuntu, é uma falha dos fabricantes de HDs. Os que não têm essa falha gastam muito menos energia no Ubuntu.