logaritmo,
uso Ubuntu, mas não vejo porque o konqueror não aceitaria Java; acho que o problema está no link simbólico. Ao criá-lo via terminal, verifique se está acrescentando ao final da linha um espaço seguide um ponto ( "...oji.so .") - não sei porque, mas é preciso.
Veja também se há plugin de Java ( e qual ) instalado no konqueror (não sei se é como no Firefox, digitando "about:plugins").
VB5