Fala Free,
Vou falar o que eu precisei fazer pra instalar o Eclipse 3.1.
A parte mais fácil foi a instalação do Eclipse propriamente dito. Para isso bastou baixá-lo do site e descompactá-lo. O detalhe é que, para rodar o Eclipse 3.1, é preciso do jdk1.5.
Checa a versão do jdk da sua máquina através do comando 'java -version'.
Acredito que seja a versão 1.4, como era no meu também.
Caso seja, baixe a versão 1.5 do site da Sun.
Faça todo o procedimento de instalação (sudo chmod +x jdk..etc etc ) e depois substitua as variáveis JAVA antigas (1.4) do $PATH pelas novas.
No meu caso eu deletei os JAVA antigos e criei novos links.
Pra testar, basta executar 'java -version' novamente.
Se a versão for a 1.5 , ae é só instalar o Eclipse 3.1 normalmente