Rodrigo, sinceramente não entendi o que você colocou, é o seguinte o ccs é compizconfig-manager e o
que o conpizfusion usa é o ccsm compizconfig-settings-manager, o pacote que o iGama colocou no tópico
dele chama corretamente o ccsm, este que você rodou não, só para testar tente criar uma nova pasta "é oculta" com o nome de .ccs, ai quando você clicar nas preferências esta ira abrir e dentro desta pasta crie um link para ccsm. Faça como teste. Depois é só desfazer.