O que baixei aqui e extrai o "Mitologia Nordica - Neil Gaiman.epub" está abrindo normalmente com o Cool Reader, entretanto, o de extensão .mobi não está abrindo, melhor dizendo, até abre, mas não está trabalhando corretamente, deforma a apresentação dos caracteres, mas não apenas no Cool Reader como também no LibreOffice.
De toda forma, insisto, no formato .epub está trabalhando normalmente.
Por primeiro é necessário saber se instalou corretamente o 'Cool Reader" e se ele está de fato funcionando.
Como o repositório se trata de uma ppa vencida e sem atualização há tempos (Latest updates cr3 183 weeks ago), isso aí dá mais de 3 anos sem atualizar, então é necessário baixar direto o pacote .deb, já que nem entrada há para a versão 16.04 Xenial ou superior do Ubuntu, resta então baixar mesmo o pacote deb, que aqui funcionou usando o Ubuntu 16.04.3.
Para o sistema cuja arquitetura é 64-bit:
wget https://launchpad.net/~vovansrnd/+archive/ubuntu/coolreader/+files/cr3_3.1.2.3-39_amd64.deb -O cr3.deb
Se o sistema for de arquitetura 32-bit:
wget https://launchpad.net/~vovansrnd/+archive/ubuntu/coolreader/+files/cr3_3.1.2.3-39_i386.deb -O cr3.deb
Uma vez baixado e estando dentro do diretório em que baixou, normalmente a pasta Downloads,
cd ~/Downloads
então é instalar fazendo:
sudo dpkg -i cr3.deb
Como irá falha em relação a algumas dependências, então precisa corrigir fazendo:
sudo apt-get install -f
Se tudo deu certo e o programa instalou corretamente, então deverá aparecer dessa forma:
sudo apt-cache policy cr3
cr3:
Instalado: 3.1.2.3-39
Candidato: 3.1.2.3-39
Tabela de versão:
*** 3.1.2.3-39 100
100 /var/lib/dpkg/status
Certificando-se de que o programa esteja corretamente instalado, então volte lá no post #2, baixe aquele .epub "Contos" do Eça de Queiróz e veja se consegue abrir no Cool Reader, para poder testar.
Consigo abrir aqui normalmente o .epub do Eça de Queiroz mencionado, mas também, como dito, está abrindo normalmente o .epub "Mitologia Nordica - Neil Gaiman.epub", sem nenhuma dificuldade.