Com um dia e meio de atraso possivelmente a resposta é inútil, mas enfim, não vejo exatamente maiores dificuldades caso tenha interrompido a execução do fsck, não deverá ocasionar um mal maior.
De toda sorte, o problema de fundo persiste, porque a demora pode estar associada a uma situação danosa no sistema de arquivo, mas a esse ponto você já deve ter o resultado do relatório e a verficação concreta do funcionamento do sistema.
Note que no relatório há uma informação de bad blocks que é importante.
editando:
lembrei de um detalhe, não precisa fechar o terminal para encerrar o processo, nesse caso poderia ter usado as teclas Ctrl C para interromper.
Vai receber uma mensagem assim: e2fsck cancelado.