Como você mesmo disse, o synaptic é uma interface gráfica para o sistema de pacotes.
Mais uma...
Oriunda do falecido Conectiva Linux, ela juntava as facilidades do apt-get do Debian com as vantagens do RPM, da RedHat.
Não sei se o usuário geral ainda tem vantagem em usá-lo em vez da Central de Programas do Ubuntu, ou algum dos outros vários front-ends mais novos disponíveis.
Enviado do meu smartphone.