smallvilly meu caro, este é um fórum sobre Ubuntu, mas vou te dar essa colher de chá!
Lembre-se, seu sistema foi instalado em outra placa mãe! Então, a não ser que você tenha substituído a placa velha pelo mesmo modelo, seu sistema tem tudo para não carregar!
São outros componentes de hardware, portanto outros drivers, e seu sistema está com os drivers antigos instalados! Então dependendo do quão diferente é a nova placa mãe, seu sistema pode mesmo nem carregar!
Quem era mestre em subir em qualquer placa mãe, sem instalar os drivers, era o saudoso Windows 98SE!
Até mesmo o Linux pode não subir conforme os driver instalados.
Se sua nova placa sobe no Ubuntu é por conta da estrutura modular dos drivers no kernel Linux. A cada novo boot ele detecta os drivers da placa mãe. Os drivers já foram "colocados" dentro do kernel, mas não estão "ativos", ao detectar determinado driver ele aí sim o carrega!
Agora, se você tivesse instalado algum driver proprietário incompatível com a nova placa mãe, aí seu sistema pode nem subir também no Linux.
O ideal é fazer uma instalação limpa em ambos os sistemas em caso de troca do modelo da placa mãe.
Passou o cartão?